Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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