Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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