Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL3Q13618 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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