Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms