Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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TCOF1Q13428 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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TCOF1Q13428 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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TCOF1Q13428 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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TCOF1Q13428 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TCOF1Q13428 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TCOF1Q13428 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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