Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SDSP20132 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SDSP20132 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SDSP20132 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SDSP20132 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SDSP20132 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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