Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FSCN1Q16658 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms