Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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