Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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