Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CDH18Q13634 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms