Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4BQ13620 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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