Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EIF4EBP1Q13541 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms