Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PRPF4BQ13523 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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PRPF4BQ13523 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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