Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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