Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms