Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRGP23470 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms