Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DMDP11532 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DMDP11532 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DMDP11532 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DMDP11532 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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