Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SHOC2Q9UQ13 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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