Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LRRIQ1Q96JM4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LRRIQ1Q96JM4 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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