Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms