Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CTXN3Q4LDR2 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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