Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms