Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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