Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDCD1Q15116 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms