Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL4A6Q14031 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms