Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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TCOF1Q13428 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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TCOF1Q13428 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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TCOF1Q13428 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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TCOF1Q13428 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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TCOF1Q13428 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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TCOF1Q13428 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TCOF1Q13428 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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