Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SEMA3BQ13214 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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