Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms