Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
FOXF1Q12946 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms