Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPREP23469 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPREP23469 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPREP23469 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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