Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ZBED1O96006 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms