Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
USP18Q9UMW8 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms