Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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