Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms