Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
LAMA3Q16787 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LAMA3Q16787 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms