Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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HTR4Q13639 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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HTR4Q13639 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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HTR4Q13639 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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HTR4Q13639 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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HTR4Q13639 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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HTR4Q13639 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HTR4Q13639 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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