Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ITGB3BPQ13352 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms