Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1BQ13112 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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