Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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