Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CEP44Q9C0F1 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CEP44Q9C0F1 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CEP44Q9C0F1 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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