Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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RTL8BQ17RB0 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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RTL8BQ17RB0 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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RTL8BQ17RB0 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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RTL8BQ17RB0 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RTL8BQ17RB0 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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RTL8BQ17RB0 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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