Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms