Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF4Q15306 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF4Q15306 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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