Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAM2Q15035 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAM2Q15035 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms