Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PICALMQ13492 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms