Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TOP3AQ13472 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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TOP3AQ13472 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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