Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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