Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP140Q13342 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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