Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1BQ13112 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms