Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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